Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms