Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms