Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AC106788.1-201ENST00000550753 2661 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 GOLGA6L2-202ENST00000345070 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms