Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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MMP19Q99542 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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MMP19Q99542 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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MMP19Q99542 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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MMP19Q99542 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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MMP19Q99542 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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MMP19Q99542 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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MMP19Q99542 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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MMP19Q99542 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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MMP19Q99542 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MMP19Q99542 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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MMP19Q99542 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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