Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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