Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CHFRQ96EP1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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