Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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