Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms