Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf40Q8IXQ3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf40Q8IXQ3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf40Q8IXQ3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf40Q8IXQ3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf40Q8IXQ3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf40Q8IXQ3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf40Q8IXQ3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf40Q8IXQ3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf40Q8IXQ3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf40Q8IXQ3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf40Q8IXQ3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf40Q8IXQ3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf40Q8IXQ3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf40Q8IXQ3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf40Q8IXQ3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
C9orf40Q8IXQ3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
C9orf40Q8IXQ3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
C9orf40Q8IXQ3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
C9orf40Q8IXQ3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
C9orf40Q8IXQ3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
C9orf40Q8IXQ3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms