Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms