Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms