Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRC8EQ6NSJ5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms