Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms