Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AP000281.2-201ENST00000427911 384 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 PRRX2-AS1-201ENST00000440413 429 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 RNF7-202ENST00000393000 805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP350Q5VT06 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms