Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms