Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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