Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CDKN3Q16667 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CDKN3Q16667 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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