Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CNGA3Q16281 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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