Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
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