Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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