Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TSTA3Q13630 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TSTA3Q13630 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TSTA3Q13630 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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