Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
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