Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms