Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

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Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RLFQ13129 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RLFQ13129 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RLFQ13129 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RLFQ13129 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RLFQ13129 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RLFQ13129 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RLFQ13129 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RLFQ13129 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RLFQ13129 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLFQ13129 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RLFQ13129 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms