Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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