Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TROQ12816 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TROQ12816 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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