Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FOXO1Q12778 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FOXO1Q12778 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FOXO1Q12778 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FOXO1Q12778 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FOXO1Q12778 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FOXO1Q12778 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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