Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGNL1Q0VF96 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms