Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms