Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms