Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms