Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMF1P82094 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMF1P82094 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMF1P82094 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMF1P82094 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMF1P82094 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms