Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms