Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 PRRG4-201ENST00000257836 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AC135012.1-201ENST00000563931 7430 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 KCNV1-202ENST00000524391 6979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 GRID2-201ENST00000282020 6117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SLC45A4-203ENST00000519067 7483 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms