Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF6P49848 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms