Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1P48651 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms