Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ME1P48163 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ME1P48163 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ME1P48163 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ME1P48163 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ME1P48163 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ME1P48163 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms