Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB2P29033 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms