Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NFKB1P19838 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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NFKB1P19838 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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NFKB1P19838 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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NFKB1P19838 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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NFKB1P19838 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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NFKB1P19838 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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NFKB1P19838 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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NFKB1P19838 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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NFKB1P19838 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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