Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPB42P16452 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPB42P16452 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPB42P16452 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPB42P16452 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPB42P16452 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPB42P16452 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPB42P16452 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPB42P16452 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPB42P16452 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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