Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYBBP04839 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms