Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCATO75600 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCATO75600 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCATO75600 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCATO75600 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCATO75600 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCATO75600 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCATO75600 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms