Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
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