Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms