Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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