Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms