Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms