Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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