Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CHKBQ9Y259 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CHKBQ9Y259 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CHKBQ9Y259 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CHKBQ9Y259 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CHKBQ9Y259 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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CHKBQ9Y259 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CHKBQ9Y259 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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