Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms